MAC0341  Introdução a Bioinformática

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OBJETIVOS:  As ciências biológicas sofreram uma importante revolução nas últimas décadas pelo uso de métodos matemático-computacionais, o que foi possível graças a introdução de novas tecnologias para medição de fenômenos moleculares. O objetivo deste curso é familiarizar o aluno: com aspectos de dinâmicas fundamentais dos seres vivos no nível de Biologia Molecular e com a evolução das espécies; com os fenômenos moleculares que são medidos; com as técnicas de medição; com os repositórios públicos de fenômenos biológicos medidos; e, finalmente, com técnicas de processamento de dados que permitem extrair informação biológica dos fenômenos medidos. Além de apresentar exemplos de problemas de bioinformática e de suas soluções.

PROGRAMA:  O funcionamento molecular dos seres vivos. O dogma básico da biologia molecular e o papel dos RNAs não codificantes. Evolução dos seres vivos: mutação do DNA e pressão evolutiva. Redes metabólicas e de sinalização celular. A investigação do funcionamento dos seres vivos através de medidas: transcriptomica, proteômica, metabolomica. As tecnologias para decodificação e medição de fenômenos. Os repositórios públicos. Medição como um processo estatístico de amostragem. Exemplos de problemas de bioinformática e algumas soluções. Inferência de redes gênicas; identificação de marcadores genéticos para condições clínicas; inferência de vias de sinalização. Algumas medidas consideradas: sequenciamento de RNA clássico e de última geração; microarrays; espectrometria de massa; western blot; gel eletroforese; PCR; preparação de bibliotecas de cDNA; sequenciamento de DNA.

RESPONSÁVEIS:  André Fujita, Junior Barrera, Roberto Cesar Marcondes Jr., Ronaldo Fumio Hashimoto.

PRÉ-REQUISITOS:  Não há.

CARGA HORÁRIA SEMANAL E NÚMERO DE CRÉDITOS:  4 horas, 4 créditos-aula.

CRITÉRIO DE AVALIAÇÃO DA APRENDIZAGEM:  Média ponderada de provas, exercícios e projetos.

BIBLIOGRAFIA BÁSICA: 

  • M.R. Green, J. Sambrook, Molecular cloning: a laboratory manual, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012.
  • J.H. Gross, Mass spectrometry: a textbook, Springer, 2004.
  • Alberts, et al., Molecular Biology of the Cell,

OBSERVAÇÃO:  Disciplina optativa nos currículos do BCC.

 

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Alguns dos oferecimentos da disciplina: