Projeto CAGE

Durante a realização dos experimentos supracitados, surgiu um novo projeto onde muitas das técnicas utilizadas para resolver o já conhecido problema do OCR podem ser reutilizadas no projeto. O projeto consiste basicamente em, em conjunto com a bioquímica, construir um sistema de análise de micro-arrays.

Para participar desse novo projeto, realizei uma série de leituras já especificadas e assisti uma série de palestras que visavam introduzir alguns conceitos de bioquímica e micro-array. Foram eles:

• 2 seminários introdutórios realizados no IME. Falou-se praticamente de um pouco da linguagem de bioquímica, uma visão geral de coisas que tornam essa área uma das mais interessantes atualmente e algumas coisas mais dirigidas à nossa proposta de atuação, enfatizando aspectos de sequenciamento e microarrays.
• Seminário sobre o Dictyostelium, um organismo que provavelmente dará origem aos primeiros microarrays que poderemos analisar.
• Seminário sobre coclo celular: fenomenologia e modelagem.
• 2 seminários sobre princípios básicos de Biologia Molecular do Gene. O objetivo foi tornar acessíveis ao pessoal do IME conceitos e métodos importantes no entendimento da análise da expressão gênica através da metodologia de microarrays de DNA. Os tópicos abordados foram: Organização e análise dos genes e Níveis de controle da expressão dos genes.
• Seminário sobre o CAGE falando de ``Análise da expressão gênica no Câncer: como o CAGE se relaciona com o projeto FAPESP/LICR de sequenciamento do genoma humano do câncer''.
• Seminário sobre microarrays num nível básico.
• Seminário de Biologia Molecular Computacional - Reconstrução Filogenética: enfoques e perspectivas.