Enzimas de Restrição

Enzimas de restrição são enzimas capazes de ``cortar'' DNA em pontos específicos. A enzima Eco RI, por exemplo, corta as moléculas quando encontra a seqüência GAATTC. Há centenas de enzimas conhecidas que reconhecem diversos padrões. Todos os padrões são palíndromos, ou seja, são seqüências iguais ao seu complemento reverso. No caso da Eco RI:

GAATTC^CR = GAATTC

Mas, justamente pelo fato de fazer os cortes em sítios específicos, as enzimas de restrição não são a melhor forma de obter uma fragmentação satisfatória, nos termos colocados acimas. Tais enzimas podem gerar fragmentos demasiadamente longos, o que não ajuda em nada quando procuramos por fragmentos com 500-700 bases. Por outro lado, elas podem gerar fragmentos muito pequenos, que também não são úteis. Por estas razões, em seqüenciamento em larga escala, prefere-se o método shotgun (canhão).